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在民國86年間,由東海大學生命科學系林惠真教授的紀錄與調查,大致上可以將高美濕地分成潮溪、草澤、沙地、碎石地、雲林莞草、泥灘地、低潮線等7種棲地類型,並記錄鳥類34科104種、蟹類7科25種、魚類3科6種、貝類7科8種、植物27科105種。

原臺中縣政府在民國93年9月29日公告高美濕地劃設為「高美野生動物保護區」,明文限制不得採集任何野生動、植物。但因大量的遊客慕名前來,造成沙灘地嚴重陸地化,使得雲林莞草和生態環境遭受破壞,若不加以保護高美濕地,試想高美濕地如果沒有雲林莞草和底棲生物,又如何能吸引各種水鳥前來覓食呢?

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