高美濕地的周邊環境、堤岸並沒有時間限制，但是如果要進入高美濕地內，只能行走木棧道，而木棧道的開放時間，一般而言是上午8點到下午6點。但因高美濕地屬於沿海地區，每天都有漲、退潮的海水活動，如因海水漲潮，木棧道將封閉不得進入。因此建議來訪之前，請先查詢海水潮汐時間或木棧道開放時間，以免剛好遇到海水漲潮而無法進入高美濕地內。

如果需要進入高美濕地的保護區核心範圍內，包括生態體驗、生態調查、海洋淨灘等活動，依「高美野生動物保護區範圍暨相關規定事項」，應先向地方主管機關、受託機關或團體申請核發許可證。請於活動日前14天，向主管機關臺中市海岸資源漁業發展所提出申請，並備妥申請公文、申請範圍區域圖、申請人身份證明文件等資料。

若是進入高美濕地的永續利用區（體驗區）內，則無需申請，民眾仍然可以自由活動。

原臺中縣政府在民國93年9月29日公告高美濕地劃設為「高美野生動物保護區」，在保護區的核心範圍內，若未經主管機關許可，不得任意進入，但如果只在永續利用區（體驗區）、周邊環境、木棧道或堤岸上休憩，則民眾仍然可以自由活動。